Капітан корабля Джеймс Т. Кірк і його команда, відправившись в п'ятирічну дослідницьку місію, продовжують шукати нові раси і цивілізації на теренах незвіданого людиною космосу. Раптово «Ентерпрайз» був атакований руйнівною і нещадною зграєю невідомих агресивних прибульців, які почали напад без попередження і спроб вийти на контакт. Бачачи, як космічне судно під потужним натиском інопланетних кораблів розсипається буквально на очах, капітан Кірк приймає рішення евакуювати команду на прилеглу планету. Опинившись далеко один від одного в абсолютно невідомому місці без будь-яких засобів порятунку, наші герої несподівано стикаються з жорстоким ворогом, котрий з якихось незрозумілих причин люто ненавидить Федерацію. Раптово на допомогу членам команди, які потрапили в складну ситуацію, приходить таємнича войовниця Джайлах, якій відомі істинні причини надмірної агресії прибульців, очолюваних безжальним Кроллом.